Nadat die Amerikaanse geleerde Eric S. Lander in 1996 formeel enkelnukleotiedpolimorfisme (SNP) as die derdegenerasie molekulêre merker voorgestel het, is SNP wyd gebruik in ekonomiese eienskapassosiasie-analise, biologiese genetiese koppelingskaartkonstruksie en menslike patogeniese geensifting., Siekte risiko diagnose en voorspelling, geïndividualiseerde dwelm sifting, en ander biologiese en mediese navorsing velde.Op die gebied van kontantgewasteling kan opsporing van SNP vroeë seleksie van vereiste eienskappe realiseer.Hierdie seleksie het die kenmerke van hoë akkuraatheid en kan effektief die inmenging van morfologie en omgewingsfaktore vermy en sodoende die teelproses aansienlik verkort.Daarom speel SNP 'n groot rol op die gebied van basiese navorsing.

Enkelnukleotiedpolimorfisme (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) verwys na die verskynsel dat daar enkelnukleotiedverskille in dieselfde posisie in die DNS-volgorde van individue van dieselfde of verskillende spesies is.Die invoeging, verwydering, omskakeling en inversie van 'n enkele basis kan almal hierdie verskil veroorsaak.In die verlede was die definisie van SNP anders as dié van mutasie.'n Variante lokus vereis dat die frekwensie van een van die allele in die populasie groter as 1% is om as 'n SNP-lokus gedefinieer te word.Met die uitbreiding van moderne biologiese teorieë en die toepassing van tegnologie is alleelfrekwensie egter nie meer 'n noodsaaklike voorwaarde om die definisie van SNP te beperk nie.Volgens die enkelnukleotiedvariasiedata wat ingesluit is in die Enkelnukleotiedpolimorfismes (dbSNP) databasis onder die Nasionale Sentrum vir Biotegnologie-inligting (NCBI), is lae-frekwensie invoeging/uitwissing, mikrosatellietvariasie, ens. ook ingesluit.

In die menslike liggaam is die frekwensie van SNP 0,1%.Met ander woorde, daar is 'n gemiddeld van een SNP-werf per 1000 basispare.Alhoewel die frekwensie van voorkoms relatief hoog is, kan nie alle SNP-terreine kandidaatmerkers wees wat met eienskappe verband hou nie.Dit hou hoofsaaklik verband met die ligging waar die SNP voorkom.

Teoreties kan SNP enige plek in die genoomvolgorde voorkom.SNP's wat in die koderende streek voorkom, kan sinonieme mutasies en nie-sinonieme mutasies produseer, dit wil sê die aminosuur verander al dan nie voor en na die mutasie.Die veranderde aminosuur veroorsaak gewoonlik dat die peptiedketting sy oorspronklike funksie verloor (missense mutasie), en kan ook translasieaborte veroorsaak (nonsensmutasie).SNP's wat in nie-koderende streke en intergeniese streke voorkom, kan mRNA-splyting, nie-koderende RNA-volgordesamestelling en die bindingsdoeltreffendheid van transkripsiefaktore en DNA beïnvloed.Die spesifieke verwantskap word in die figuur getoon:

SNP tipes:

Verskeie algemene SNP-tikmetodes en hul vergelyking

Volgens verskillende beginsels word algemene SNP-opsporingsmetodes in die volgende kategorieë verdeel:

Klassifikasie vergelyking van opsporing metodes

Let wel: Gelys in die tabel word tans meer algemene SNP opsporing metodes gebruik, ander opsporing metodes soos spesifieke plek hibridisasie (ASH), spesifieke plek primer uitbreiding (ASPE), enkel basis uitbreiding (SBCE), spesifieke plek sny (ASC), geen chip tegnologie, massaspektrometrie tegnologie, ens. is nie geklassifiseer en vergelyk nie.

Die koste en tyd van nukleïensuur suiwering in die bogenoemde verskeie algemene SNP opsporing metodes is onvermydelik.Verwante stelle gebaseer op Foregene se direkte PCR-tegnologie kan egter PCR- of qPCR-amplifikasie direk op ongesuiwerde monsters uitvoer, wat ongekende gerief vir SNP-opsporing bring.

Foregene se direkte PCR-reeksprodukte laat monstersuiweringsstappe eenvoudig en rofweg weg, wat die tyd en koste wat nodig is om sjablone voor te berei aansienlik verminder.Die unieke Taq-polimerase het uitstekende amplifikasievermoë en kan 'n verskeidenheid inhibeerders van komplekse amplifikasie-omgewings verdra.Hierdie eienskappe bied 'n tegniese waarborg vir die verkryging van hoë-opbrengs spesifieke produkte.Foregene Direct PCR/qPCR kits vir verskeie monstertipes, soos: diereweefsels (rotstert, sebravis, ens.), plantblare, sade (insluitend polisakkariede en polifenolmonsters), ens.